12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1230 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1230  VanZ family protein  100 
 
 		 118 aa  236  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.794314  hitchhiker  0.00101511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0437  hypothetical protein  38.39 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  38 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  32.69 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  31.09 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  29.9 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0460  VanZ family protein  38.14 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  39.13 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5688  VanZ family protein  36.47 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01200  hypothetical protein  28.16 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3829  VanZ family protein  30.09 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.942243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>