36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2680 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  65.43 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  53.57 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  46.32 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  51.19 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  36.63 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1795  VanZ family protein  41.67 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.09464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  41.05 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  30 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  41.25 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1230  VanZ family protein  39.47 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.794314  hitchhiker  0.00101511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  40 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  40.79 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  39.44 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1710  hypothetical protein  32.14 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  40 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  48.05 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1976  VanZ family protein  36.56 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.999512  normal  0.218225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  40.79 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  37.33 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  43.28 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  36.84 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  37.66 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1678  hypothetical protein  32.18 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  40.79 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  41.77 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  36.67 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  36.9 
 
 		 136 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  40 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  34.67 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3106  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0222  hypothetical protein  33.71 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  37.84 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01200  hypothetical protein  31.52 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1516  hypothetical protein  40.45 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00121071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>