13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6628 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  100 
 
 		 108 aa  216  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1230  VanZ family protein  38 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.794314  hitchhiker  0.00101511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0460  VanZ family protein  40.21 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01200  hypothetical protein  27.83 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  36.28 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0188  VanZ family protein  26.47 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.68802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  34.58 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  31.65 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.49 
 
 		 392 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3829  VanZ family protein  25.44 
 
 		 135 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.942243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0437  hypothetical protein  27.43 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  32.29 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>