16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01200 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01200  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  274  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0188  VanZ family protein  33.04 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.68802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  27.83 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2830  hypothetical protein  40.43 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  39.6 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3829  VanZ family protein  28.3 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.942243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  30.56 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1655  hypothetical protein  30.36 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04895  VanZ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10980)  22.77 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.393402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1710  hypothetical protein  30.17 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  32.56 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1230  VanZ family protein  28.16 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.794314  hitchhiker  0.00101511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3428  VanZ family protein  37.04 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0239273 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1429  VanZ family protein  27.84 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  27.93 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  30.84 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>