12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3106 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3106  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  37.23 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0222  hypothetical protein  31.82 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1429  VanZ family protein  35.71 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2981  VanZ family protein  32.67 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.668765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  33.96 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2761  hypothetical protein  31.19 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  30.43 
 
 		 165 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3918  hypothetical protein  37.89 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 		 392 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  29.13 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>