18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2981 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2981  VanZ family protein  100 
 
 		 189 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.668765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  45 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2830  hypothetical protein  36.97 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 120 aa  47.4  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3106  hypothetical protein  34.64 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  32.99 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  35.35 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  35.35 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  32.69 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  35.35 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  32.61 
 
 		 384 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  31.82 
 
 		 126 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  34.38 
 
 		 120 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  48 
 
 		 398 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>