42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0247 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  100 
 
 		 384 aa  744    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  75.53 
 
 		 398 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  63.91 
 
 		 364 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  63.04 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  57.14 
 
 		 377 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  59.68 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  58.31 
 
 		 365 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  57.77 
 
 		 365 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  59.36 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  44.81 
 
 		 368 aa  249  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  43.1 
 
 		 359 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  36.77 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  36.49 
 
 		 416 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  39.15 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  39.15 
 
 		 421 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  39.43 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  38.03 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  38.31 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  35.65 
 
 		 385 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  34.88 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  39.12 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  37.54 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  37.54 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  37.54 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  36.26 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  36.92 
 
 		 383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  45.96 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  45.96 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  45.96 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  56.36 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  31.74 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  44.34 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  36.99 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  35.71 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  40.83 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  30.93 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  46 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  40.48 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  40.48 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  39.53 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4646  hypothetical protein  29.41 
 
 		 494 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.387775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0208  hypothetical protein  32.9 
 
 		 773 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.228151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>