27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0769 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  256  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  60.91 
 
 		 119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  58.68 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  62.73 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  62.73 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  62.73 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  61.26 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  60.33 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  60.91 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  60.91 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  60.91 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  60 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  65.38 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  56.73 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  61.54 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  32.11 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  45.95 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  34.48 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  39.68 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1096  hypothetical protein  31.76 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.622776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0059  VanZ family protein  29.66 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.861846 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  31.03 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  37.35 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1288  hypothetical protein  36.36 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.776572  normal  0.463218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  30.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>