28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2894 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  100 
 
 		 126 aa  256  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  69.75 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  66.09 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  65.22 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  65.22 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  65.22 
 
 		 120 aa  157  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  65.22 
 
 		 120 aa  157  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  68.14 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  64.35 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  65.22 
 
 		 120 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  65.22 
 
 		 120 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  65.22 
 
 		 120 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  64.46 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  58.68 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  60.18 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  55.65 
 
 		 120 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1096  hypothetical protein  35.04 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.622776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  37.76 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  36.19 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  35.53 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  36.54 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  32.22 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  37.23 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  34.88 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  29.41 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  31.76 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  27.69 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>