36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3617 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  100 
 
 
134 aa  261  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  41.67 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  39.42 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  32.81 
 
 
146 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  32.11 
 
 
126 aa  57.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  32.71 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  37.76 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  36.54 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  37.89 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  33.66 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  31.97 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  37.5 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  31.97 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  37.5 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  37.5 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  31.97 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  40.38 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  31.97 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  36.11 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  37.66 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  38.68 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  36.36 
 
 
136 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  31.91 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  36.08 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  38.27 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  33.82 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  39.08 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  35.06 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  33 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  33.33 
 
 
121 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  38.36 
 
 
119 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  34.62 
 
 
139 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1976  VanZ family protein  29.46 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.999512  normal  0.218225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7300  hypothetical protein  29.82 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471686  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  34.31 
 
 
140 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>