32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1976 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1976  VanZ family protein  100 
 
 		 134 aa  261  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.999512  normal  0.218225 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  33.33 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  37.78 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  39.24 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  28.7 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  28.12 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  36.17 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  35.56 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  31.11 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  35.04 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  33.33 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  28.95 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  33.59 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  33.33 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2981  VanZ family protein  36.96 
 
 		 189 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.668765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  30.48 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  32.11 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  36.05 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  31.91 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  37.62 
 
 		 119 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  37.08 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3036  VanZ family protein  30.95 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000617485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  33.9 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  31.11 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  31.11 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  28.4 
 
 		 1200 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  31.11 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  34.18 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>