31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1938 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  100 
 
 		 109 aa  207  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  65.43 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  50 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  46.08 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  42.5 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  51.14 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  31.91 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  42.34 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  40.35 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  33.02 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1795  VanZ family protein  47.5 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.09464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  36.9 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  44.44 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  38.89 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1710  hypothetical protein  36.27 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  42.42 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  39.06 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  39.06 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  39.51 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  34.44 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  32.58 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  32.58 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  27.43 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  42.19 
 
 		 121 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1678  hypothetical protein  35.63 
 
 		 120 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  32.58 
 
 		 120 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  32.58 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1230  VanZ family protein  33.72 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.794314  hitchhiker  0.00101511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  36.96 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1451  hypothetical protein  30.95 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>