14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3428 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3428  VanZ family protein  100 
 
 		 130 aa  255  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0239273 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  50.83 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  49.59 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  41.51 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0188  VanZ family protein  28.44 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.68802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  39.29 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2830  hypothetical protein  33.05 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  33.33 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  37.76 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  40.2 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01200  hypothetical protein  34.23 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  32.5 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2422  VanZ family protein  34.55 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  30.93 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>