21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0145 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0145  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  65.25 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  55.64 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  46.21 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0750  hypothetical protein  44.36 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  32.99 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  30.93 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  36.71 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  30.93 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  30.93 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  30.93 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  36.71 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  36.71 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  36.71 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  31.76 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  35.42 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  35.23 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  38.27 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  34.94 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3036  VanZ family protein  37.36 
 
 		 136 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000617485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  32.61 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>