41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0264 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  100 
 
 		 365 aa  705    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  99.45 
 
 		 365 aa  701    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  70.99 
 
 		 377 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  76.18 
 
 		 372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  62.47 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  61.5 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  58.58 
 
 		 384 aa  336  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  59.62 
 
 		 371 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  68.21 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  43.17 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  47.03 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  34.78 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  33.24 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  36.78 
 
 		 421 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  35.97 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  37.29 
 
 		 383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  38.84 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  36.89 
 
 		 408 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  37.85 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  37.85 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  37.85 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  37.57 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  39.95 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  39.95 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  36.97 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  33.16 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  38.62 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  35.34 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  34.43 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  37.2 
 
 		 393 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  37.2 
 
 		 399 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  37.99 
 
 		 397 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  34.49 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  31.76 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  37.42 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  36.13 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  40.68 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  40 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  31.62 
 
 		 248 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  30.73 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2345  VanZ family protein  33.08 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>