42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0377 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  746    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  94.71 
 
 
403 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  94.96 
 
 
403 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  94.46 
 
 
397 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  92.19 
 
 
393 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  92.19 
 
 
399 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  72.7 
 
 
383 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  71.51 
 
 
383 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  71.51 
 
 
383 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  71.51 
 
 
383 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  71.35 
 
 
383 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  71.97 
 
 
383 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  73.24 
 
 
383 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  63.37 
 
 
386 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  58.56 
 
 
385 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  88.89 
 
 
248 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  58.82 
 
 
385 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  44.85 
 
 
416 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  44.2 
 
 
440 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  45.15 
 
 
421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  44.9 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  44.06 
 
 
408 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  35.89 
 
 
364 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  38.48 
 
 
398 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  37.39 
 
 
384 aa  143  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  36.03 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  33.24 
 
 
364 aa  140  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  35.18 
 
 
377 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  35.53 
 
 
351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  37.36 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  35.73 
 
 
359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  36.87 
 
 
365 aa  110  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  36.6 
 
 
365 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  32.24 
 
 
368 aa  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  36.68 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  40.39 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  44.25 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  38.89 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  38.79 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  40.74 
 
 
404 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4646  hypothetical protein  24.12 
 
 
494 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.387775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0115  VanZ family protein  38.16 
 
 
150 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.409766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>