15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4646 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4646  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1001    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.387775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1556  VanZ family protein  23.39 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2345  VanZ family protein  31.15 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5765  hypothetical protein  33 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1239  hypothetical protein  35.56 
 
 		 808 aa  57  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1547  VanZ family protein  30.25 
 
 		 1131 aa  53.5  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3546  ATPase  27.54 
 
 		 826 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  27.27 
 
 		 403 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0208  hypothetical protein  24.84 
 
 		 773 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0107  VanZ family protein  27.91 
 
 		 1122 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  25.69 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  30.17 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1841  VanZ family protein  35.8 
 
 		 173 aa  44.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2429  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1089 aa  43.9  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3474  VanZ family protein  37.8 
 
 		 148 aa  43.5  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000194917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>