17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0115 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0115  VanZ family protein  100 
 
 
150 aa  285  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.409766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4735  VanZ family protein  34.82 
 
 
189 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1422  VanZ family protein  35.46 
 
 
223 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2345  VanZ family protein  32.86 
 
 
444 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  34.67 
 
 
383 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  34.67 
 
 
383 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  35.21 
 
 
383 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3210  VanZ family protein  29.25 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  35.21 
 
 
383 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  35.21 
 
 
383 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  38.03 
 
 
397 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0107  VanZ family protein  37.84 
 
 
1122 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  38.03 
 
 
403 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  38.03 
 
 
403 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  36.47 
 
 
416 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2373  VanZ family protein  29.66 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.521595  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  32.94 
 
 
440 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>