41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2946 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  98.69 
 
 		 383 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  100 
 
 		 383 aa  726    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  92.43 
 
 		 383 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  91.12 
 
 		 383 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  92.43 
 
 		 383 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  92.43 
 
 		 383 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  88.77 
 
 		 383 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  73.24 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  73.95 
 
 		 403 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  74.21 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  74.86 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  72.7 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  71.84 
 
 		 399 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  64.36 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  61.97 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  63.03 
 
 		 385 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  45.45 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  43.55 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  70.39 
 
 		 248 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  43.46 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  42.33 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  43.19 
 
 		 421 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  36.49 
 
 		 364 aa  166  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  34.85 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  39.08 
 
 		 398 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  35.54 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  36.9 
 
 		 351 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  35.68 
 
 		 372 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  35.99 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  37.74 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  34.23 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  37.74 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  33.07 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  36.36 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  45.13 
 
 		 142 aa  91.3  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  38.76 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  52.04 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  37.98 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  38.14 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  43.9 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0115  VanZ family protein  34.15 
 
 		 150 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.409766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>