42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0435 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  99.5 
 
 		 397 aa  743    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  99.75 
 
 		 403 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  100 
 
 		 403 aa  757    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  94.96 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  97.02 
 
 		 399 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  96.98 
 
 		 393 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  73.42 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  73.39 
 
 		 383 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  73.39 
 
 		 383 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  73.39 
 
 		 383 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  73.24 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  74.21 
 
 		 383 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  73.32 
 
 		 383 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  63.49 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  95.24 
 
 		 248 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  59.63 
 
 		 385 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  59.63 
 
 		 385 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  45.65 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  44.18 
 
 		 440 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  44.75 
 
 		 421 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  44.75 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  43.41 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  36.54 
 
 		 364 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  40 
 
 		 398 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  37.5 
 
 		 384 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  33.8 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  35.16 
 
 		 377 aa  139  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  36.41 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  37.74 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  34.87 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  36.49 
 
 		 359 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  37.93 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  37.93 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  34.07 
 
 		 368 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  38.04 
 
 		 375 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  41.23 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  44.74 
 
 		 142 aa  80.9  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  38.89 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  38.79 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  39.81 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4646  hypothetical protein  24.46 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.387775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0115  VanZ family protein  38.16 
 
 		 150 aa  43.5  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.409766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>