38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3880 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  100 
 
 		 375 aa  706    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  40.24 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  36 
 
 		 364 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  30.67 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  32.05 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  37.77 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  34.48 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  35.56 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  37.5 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  36.26 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  30.96 
 
 		 421 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  30.96 
 
 		 421 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  36.64 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  31.59 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  34.35 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  34.35 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  34.35 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  35.83 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  33.05 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  34.29 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  30.29 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  32.1 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  33.33 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  30.21 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  36.96 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  36.14 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  36.14 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  31.76 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  41.23 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  43.12 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  42.73 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  42.18 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  40.87 
 
 		 142 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  39.52 
 
 		 429 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  33.71 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  33.62 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  31.01 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  30.73 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>