34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1937 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  100 
 
 		 429 aa  851    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  34.59 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  35.88 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  44.63 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  31.73 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  40.16 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  37.56 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  39.68 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  40.5 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  37.96 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  27.27 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  37.96 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  37.96 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  39.45 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  34.95 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  34.82 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  31.55 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  40.35 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  39.47 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  37.14 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  37.14 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  37.14 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  34.62 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  36.19 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  36.19 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  33.65 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  32.79 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  33.62 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  33.62 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  33.62 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  33.63 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1547  VanZ family protein  31.39 
 
 		 1131 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  36.46 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  40.95 
 
 		 359 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>