38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1966 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  100 
 
 		 364 aa  717    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1673  VanZ family protein  79.31 
 
 		 142 aa  192  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  36.39 
 
 		 440 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  36.94 
 
 		 416 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  35.71 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  33.71 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  35.48 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  35.48 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  35.48 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  33.43 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  33.89 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  33.43 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  34.68 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  34.64 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  34.34 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  34.31 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  33.52 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  33.52 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  34.73 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  32.96 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  29.36 
 
 		 351 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  30.64 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  33.8 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  32.12 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  32.12 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  31.76 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  29.89 
 
 		 368 aa  96.3  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  32.04 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  32.93 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  39.09 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  30.62 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  30.21 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  36.97 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  34.45 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  35.29 
 
 		 429 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  36.45 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  32.54 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2345  VanZ family protein  27.19 
 
 		 444 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>