38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4234 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  100 
 
 		 359 aa  686    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  52.42 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  46.02 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  45.28 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  44.35 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  43.3 
 
 		 371 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  43.1 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  46.44 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  45.94 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  46.15 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  45.18 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  33.98 
 
 		 440 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  33.15 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  35.26 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  35.53 
 
 		 421 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  36.46 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  33.51 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  33.51 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  33.51 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  34.33 
 
 		 383 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  34.69 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  33.88 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  34.96 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  33.96 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  36.28 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  36.01 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  34.6 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  32.69 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  32.43 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  35.23 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  35.23 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  34.69 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  32.33 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  30.08 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  42.61 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2449  VanZ family protein  41.18 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1937  VanZ like protein  40 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  30.83 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>