36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1365 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0062  hypothetical protein  99.6 
 
 
393 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0228  hypothetical protein  99.6 
 
 
399 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1365  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0435  VanZ like protein  95.63 
 
 
403 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.407742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0454  vanZ family protein  95.24 
 
 
403 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0377  hypothetical protein  90.08 
 
 
397 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0616  hypothetical protein  95.24 
 
 
397 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2808  VanZ like protein  68.72 
 
 
383 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2906  VanZ family protein  69.1 
 
 
383 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2282  VanZ like protein  69.1 
 
 
383 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2897  VanZ like protein  69.1 
 
 
383 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0823615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6239  VanZ like protein  67.81 
 
 
383 aa  299  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0407  VanZ family protein  68.24 
 
 
383 aa  287  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0301238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2946  VanZ like protein  69.96 
 
 
383 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0209  VanZ family protein  57.74 
 
 
386 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0495  VanZ family protein  54.59 
 
 
385 aa  215  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750615  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4221  hypothetical protein  54.59 
 
 
385 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  37.5 
 
 
416 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  34.85 
 
 
440 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0172  VanZ family protein  34.94 
 
 
421 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0179  VanZ family protein  34.44 
 
 
421 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0317  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1966  VanZ family protein  33.56 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4234  VanZ family protein  31.95 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.375159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  29.46 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0329  VanZ family protein  32.29 
 
 
372 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0308  hypothetical protein  31.91 
 
 
368 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0382  VanZ family protein  29.05 
 
 
377 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.361404  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0264  VanZ family protein  31.76 
 
 
365 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.017314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4924  VanZ family protein  30.86 
 
 
371 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000201662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0269  VanZ family protein  31.76 
 
 
365 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659344  hitchhiker  0.00000236322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  47.83 
 
 
398 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4156  VanZ like protein  42.5 
 
 
351 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.159968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0247  VanZ like protein  41.46 
 
 
384 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0186575  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3880  VanZ family protein  33.95 
 
 
375 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0380  VanZ family protein  38.46 
 
 
374 aa  48.9  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414114  normal  0.323719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>