19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0488 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  100 
 
 
761 aa  1588    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0251  heparinase II/III-like  24.23 
 
 
772 aa  179  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.884612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2833  hypothetical protein  23.45 
 
 
893 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00592352  normal  0.0101157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2894  heparinase II/III family protein  22.57 
 
 
694 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.64 
 
 
1246 aa  68.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  24.57 
 
 
1200 aa  67.8  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  20.36 
 
 
628 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2408  Heparinase II/III family protein  25.42 
 
 
772 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0504135  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2409  Heparinase II/III family protein  27.7 
 
 
818 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  24.67 
 
 
644 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  20.2 
 
 
629 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  24.66 
 
 
1260 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  21.72 
 
 
847 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1999  hypothetical protein  23.27 
 
 
948 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  21.2 
 
 
626 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03380  expressed protein  20.94 
 
 
843 aa  48.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  31.46 
 
 
634 aa  47.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  22.83 
 
 
968 aa  45.8  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  20.63 
 
 
566 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>