23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2603 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  100 
 
 		 637 aa  1316    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  43.73 
 
 		 647 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  28.15 
 
 		 628 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  29.26 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  23.94 
 
 		 660 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  25.93 
 
 		 581 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  24.24 
 
 		 644 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  24.13 
 
 		 649 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  24.14 
 
 		 649 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  22.83 
 
 		 597 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  23.11 
 
 		 601 aa  111  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  23.61 
 
 		 645 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  23.46 
 
 		 646 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  24.4 
 
 		 623 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  21.1 
 
 		 598 aa  94.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  21.93 
 
 		 676 aa  90.5  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  23.78 
 
 		 847 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  23.35 
 
 		 629 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  22.41 
 
 		 628 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  22.29 
 
 		 618 aa  54.7  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  20.38 
 
 		 626 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  20.23 
 
 		 1246 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  19.76 
 
 		 624 aa  44.3  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>