More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0306 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 473 aa  945    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1353  extracellular solute-binding protein family 1  38.01 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1283  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.0000000346676  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.24 
 
 		 430 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.24 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  26.24 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.24 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 459 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  35.07 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  30.89 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  31.38 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  31.84 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  31.67 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  26.78 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.28 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  33.12 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  33.17 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.6 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  28.79 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  26.28 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  27.1 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  26.91 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.51 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  31.36 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  32.12 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.18 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  32.37 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 450 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.75 
 
 		 430 aa  54.7  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 434 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 439 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  18.88 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  28.68 
 
 		 407 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 414 aa  53.9  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5060  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 421 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5800  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 421 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 423 aa  53.5  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 421 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 426 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.52 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 421 aa  53.5  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.96 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0577  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0255  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.52 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>