More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0137 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 453 aa  906    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  47.7 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  46.55 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11510  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.98 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 460 aa  236  9e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.51 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.86 
 
 		 416 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.31 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.43 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 414 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.53 
 
 		 442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.38 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 479 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.05 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1639  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.12 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 447 aa  96.7  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 415 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 420 aa  93.6  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.92 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 457 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 445 aa  87  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.94 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.73 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 488 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.17 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.74 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 901 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.93 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.28 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  25.94 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.99 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  23.1 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  23.61 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.94 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3152  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 970 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  24.57 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 497 aa  67  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.14 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.88 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.56 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  23.61 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>