135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1627 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  100 
 
 		 276 aa  553  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  59.13 
 
 		 453 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  49.3 
 
 		 397 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  44.3 
 
 		 397 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  36.8 
 
 		 413 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  46.36 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  35.69 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  43.24 
 
 		 414 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  47.18 
 
 		 420 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  46.81 
 
 		 419 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 393 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  50 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  52.34 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  45.27 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  44.59 
 
 		 384 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  47.69 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 425 aa  99  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  42.76 
 
 		 428 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  46.38 
 
 		 392 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 403 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  45.07 
 
 		 421 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 479 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  51.55 
 
 		 394 aa  95.9  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  48.11 
 
 		 404 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  40.14 
 
 		 428 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  36.5 
 
 		 414 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  40.37 
 
 		 386 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  44.36 
 
 		 539 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  46.3 
 
 		 429 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  40.97 
 
 		 428 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  40.97 
 
 		 428 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  40.97 
 
 		 428 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  47.12 
 
 		 393 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  38.19 
 
 		 418 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  48.96 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  50.93 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  31.16 
 
 		 405 aa  52.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  51.11 
 
 		 486 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  46.67 
 
 		 512 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  48 
 
 		 512 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  42.42 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 563 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  41.82 
 
 		 529 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 494 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  28.95 
 
 		 371 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  41.89 
 
 		 393 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 371 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  27.83 
 
 		 371 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 371 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  27.83 
 
 		 371 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.19 
 
 		 445 aa  49.3  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2110  transcriptional regulator, CdaR  24.58 
 
 		 386 aa  48.9  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  27.41 
 
 		 371 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 517 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  39.29 
 
 		 511 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  41.18 
 
 		 406 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  39.34 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0622  putative transcriptional regulator, PucR family  23.72 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  35.05 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  28.92 
 
 		 371 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26.32 
 
 		 371 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  26.32 
 
 		 371 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  47.73 
 
 		 386 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  31.58 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  31.58 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  32.1 
 
 		 371 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  48.08 
 
 		 514 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  38.03 
 
 		 421 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  34.41 
 
 		 554 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  40 
 
 		 515 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  40 
 
 		 515 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  55 
 
 		 459 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  40 
 
 		 515 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  29.09 
 
 		 405 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  33.03 
 
 		 420 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  55 
 
 		 454 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 540 aa  45.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  30.84 
 
 		 418 aa  45.4  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 390 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 480 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  51.22 
 
 		 681 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  39.29 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.22 
 
 		 501 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  36.23 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  31.69 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 526 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  32.39 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  33.85 
 
 		 478 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  39.66 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  45.24 
 
 		 611 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  30.77 
 
 		 405 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 501 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  36.23 
 
 		 562 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  28.38 
 
 		 359 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  39.66 
 
 		 411 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.07 
 
 		 540 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  31.06 
 
 		 422 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 410 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>