More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0966 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2698  RNA polymerase sigma factor RpoD  73.47 
 
 		 685 aa  965    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7520  RNA polymerase sigma factor RpoD  66.37 
 
 		 665 aa  867    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3299  RNA polymerase sigma factor RpoD  67.2 
 
 		 685 aa  892    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.269398  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_004310  BR1479  RNA polymerase sigma factor RpoD  78.39 
 
 		 672 aa  1011    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0621  RNA polymerase sigma factor RpoD  65.78 
 
 		 666 aa  860    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3036  RNA polymerase sigma factor RpoD  60.28 
 
 		 650 aa  768    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672133  normal  0.0730738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2223  RNA polymerase sigma factor RpoD  72.78 
 
 		 684 aa  968    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6775  RNA polymerase sigma factor RpoD  66.07 
 
 		 702 aa  852    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2440  RNA polymerase sigma factor RpoD  74.83 
 
 		 717 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00995293  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1627  RNA polymerase sigma factor RpoD  67.01 
 
 		 683 aa  875    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00680574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1481  RNA polymerase sigma factor RpoD  66.57 
 
 		 698 aa  855    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0395  RNA polymerase sigma factor RpoD  62.06 
 
 		 668 aa  770    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1434  RNA polymerase sigma factor RpoD  78.39 
 
 		 672 aa  1011    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.960837  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0610  RNA polymerase sigma factor RpoD  65.63 
 
 		 718 aa  858    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2882  RNA polymerase sigma factor RpoD  60.88 
 
 		 696 aa  787    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2956  RNA polymerase sigma factor RpoD  73.54 
 
 		 685 aa  964    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661846  normal  0.765968 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0966  RNA polymerase sigma factor RpoD  100 
 
 		 666 aa  1355    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0575289  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4131  RNA polymerase sigma factor RpoD  65.74 
 
 		 714 aa  856    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2235  RNA polymerase sigma factor RpoD  59.58 
 
 		 667 aa  744    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3450  RNA polymerase sigma factor RpoD  61.31 
 
 		 668 aa  768    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0971  RNA polymerase sigma factor RpoD  75.17 
 
 		 702 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0743249  hitchhiker  0.00275822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0862  RNA polymerase sigma factor RpoD  59.15 
 
 		 638 aa  744    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0093579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2261  RNA polymerase sigma factor RpoD  62.61 
 
 		 664 aa  793    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.435799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3972  RNA polymerase sigma factor RpoD  66.22 
 
 		 711 aa  861    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2866  RNA polymerase sigma factor RpoD  64.87 
 
 		 717 aa  860    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0431  RNA polymerase sigma factor RpoD  59.37 
 
 		 674 aa  755    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0586  RNA polymerase sigma factor RpoD  65.93 
 
 		 667 aa  861    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  0.0214442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1688  RNA polymerase sigma factor RpoD  76.93 
 
 		 671 aa  996    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2141  RNA polymerase sigma factor RpoD  62.06 
 
 		 664 aa  781    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.320176  normal  0.578732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0979  RNA polymerase sigma factor RpoD  59.31 
 
 		 669 aa  752    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0235491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4072  RNA polymerase sigma factor RpoD  61.26 
 
 		 664 aa  766    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1465  RNA polymerase sigma factor RpoD  75 
 
 		 668 aa  971    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2049  RNA polymerase sigma factor RpoD  62.06 
 
 		 668 aa  770    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0573  RNA polymerase sigma factor RpoD  65.28 
 
 		 659 aa  854    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1238  RNA polymerase sigma factor RpoD  68.9 
 
 		 666 aa  867    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2317  RNA polymerase sigma factor RpoD  70.62 
 
 		 656 aa  877    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.1091  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2129  RNA polymerase sigma factor RpoD  60 
 
 		 710 aa  773    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.22382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3104  RNA polymerase sigma factor RpoD  73.38 
 
 		 681 aa  969    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.218533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6775  RNA polymerase sigma factor RpoD  66.67 
 
 		 666 aa  879    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0841  RNA polymerase sigma factor RpoD  61.55 
 
 		 667 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4265  RNA polymerase sigma factor RpoD  66.52 
 
 		 649 aa  825    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.914604  normal  0.695759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0805  RpoD family RNA polymerase sigma factor  46.97 
 
 		 683 aa  554  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469743 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0315  RNA polymerase sigma factor rpoD  46.19 
 
 		 622 aa  546  1e-154  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0760  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.7 
 
 		 622 aa  541  9.999999999999999e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.856067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2057  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.23 
 
 		 707 aa  515  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00133668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2994  RNA polymerase sigma-70 factor  46.15 
 
 		 599 aa  512  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6393  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  45.16 
 
 		 697 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2322  sigma 70 (RpoD)  45.31 
 
 		 644 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000648058  hitchhiker  0.00289182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2606  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.08 
 
 		 855 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10712  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2697  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.19 
 
 		 610 aa  507  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.057224  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2485  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  44.08 
 
 		 801 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00848  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.67 
 
 		 620 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0045  hypothetical protein  47.13 
 
 		 602 aa  505  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250484  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0044  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.97 
 
 		 621 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00416651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3097  sigma 70 (RpoD)  45.83 
 
 		 784 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.884131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1235  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.02 
 
 		 595 aa  504  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1406  RpoD family RNA polymerase sigma factor  44.4 
 
 		 781 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001624  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.74 
 
 		 620 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.294566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47000  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.69 
 
 		 620 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4028  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.52 
 
 		 615 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2820  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.53 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1041  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  48.55 
 
 		 612 aa  502  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.28445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2058  RpoD family RNA polymerase sigma factor  44.13 
 
 		 635 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.0381419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1013  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  45.24 
 
 		 586 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3489  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.51 
 
 		 611 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0495804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0548  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.7 
 
 		 612 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0783  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.89 
 
 		 611 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.060586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6774  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.53 
 
 		 681 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.669833  normal  0.0681029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0461  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  46.24 
 
 		 608 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0623  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.85 
 
 		 623 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0703  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.85 
 
 		 623 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01730  RNA polymerase sigma factor  46.32 
 
 		 611 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0157743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2516  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  46.25 
 
 		 598 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1212  RpoD family RNA polymerase sigma factor  44.14 
 
 		 599 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.389301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0537  RNA polymerase sigma-70 factor  46.26 
 
 		 616 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4641  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.26 
 
 		 616 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3473  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.8 
 
 		 631 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0442977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1762  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  43.75 
 
 		 754 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.578035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0418  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.2 
 
 		 616 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2310  RNA polymerase sigma factor rpoD (sigma-70)  46.52 
 
 		 621 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2283  RNA polymerase sigma factor rpoD (sigma-70)  46.52 
 
 		 621 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2678  RNA polymerase, sigma(70) factor  43.57 
 
 		 588 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1970  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  45.02 
 
 		 631 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.53576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2336  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.02 
 
 		 624 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1072  RpoD family RNA polymerase sigma factor  45.61 
 
 		 612 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.321598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2834  RNA polymerase sigma factor RpoD-like protein  45.07 
 
 		 617 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0916822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3035  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  44.94 
 
 		 619 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2996  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  45.5 
 
 		 614 aa  485  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000465174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1153  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  45.38 
 
 		 611 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000483168  normal  0.0896301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4300  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.28 
 
 		 647 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2562  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  44.22 
 
 		 754 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0018126 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1784  RNA polymerase sigma factor RpoD  44.26 
 
 		 698 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.101726  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1575  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  45.85 
 
 		 623 aa  472  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0235989  normal  0.0103568 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0494  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  43.32 
 
 		 590 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00018772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2457  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  43.93 
 
 		 588 aa  475  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.36607  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0393  RNA polymerase sigma factor  44.26 
 
 		 698 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.735984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1370  RpoD family RNA polymerase sigma factor  42.4 
 
 		 590 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2052  sigma-70 factor  43.7 
 
 		 589 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0289381  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1806  sigma 70 (RpoD)  42.77 
 
 		 594 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803488  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1894  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  43.69 
 
 		 587 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0780433  normal  0.0147198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>