More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0440 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  64.49 
 
 		 347 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 359 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  36.08 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 378 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  31.14 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  29.31 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  32.42 
 
 		 376 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  33.21 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  27.16 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  34.16 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 76 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  26.46 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  29.61 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 550 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 556 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0766  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 178 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 176 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 178 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  54.72 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 492 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 213 aa  52.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 146 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 501 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.9 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 938 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 960 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  43.1 
 
 		 917 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.62 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 492 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  44.07 
 
 		 839 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  42.31 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 215 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 910 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.06 
 
 		 894 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 224 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 918 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 217 aa  49.7  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 956 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 228 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 240 aa  49.3  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1569  putative transcription regulator protein  36.25 
 
 		 181 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.33 
 
 		 981 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1984  transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 		 181 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 959 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 967 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.02 
 
 		 862 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  42.31 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 882 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1654  transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 		 181 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00914552  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 916 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 947 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 927 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2775  transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.257993  normal  0.934511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0269  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 499 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  37.29 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>