More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0766 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0766  response regulator receiver protein  100 
 
 		 364 aa  746    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  44.62 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  24.26 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2440  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119534  normal  0.0380024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  35.64 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  32.85 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1665  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3341  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 275 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0108642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0228  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  46.43 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3149  response regulator receiver protein  39.24 
 
 		 325 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0415975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 333 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 320 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 799 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 1019 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  33.82 
 
 		 904 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 959 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  42.59 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  38.33 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  29.66 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13440  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.83 
 
 		 509 aa  51.6  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 206 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0262  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 217 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 219 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 254 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 254 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 219 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 301 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  40.32 
 
 		 900 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 219 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 768 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 227 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2108  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 516 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00926757  normal  0.183235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 519 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 284 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 208 aa  50.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 203 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 306 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 895 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  34.48 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 217 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 270 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 212 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  46 
 
 		 210 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 222 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  46 
 
 		 210 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  48 
 
 		 119 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  44 
 
 		 471 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 204 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  46 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  46 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  46 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  46 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2824  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 550 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  46 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 243 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 151 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 876 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 229 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  46 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 550 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 217 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0597  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 493 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.882562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 556 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  44.07 
 
 		 222 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 		 901 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0747  transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 		 176 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>