More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3182 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  74.86 
 
 		 193 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  52.57 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  43.32 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  42.35 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  36.79 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  38.29 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.18 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.71 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  34.21 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  34.64 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  37.72 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  31.76 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  48.57 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  30 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  33.75 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  29.34 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  27.75 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  31.82 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.32 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.65 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.09 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  41.05 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.92 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  31.62 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  50 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  50 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  33.91 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  40 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  30.22 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.33 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  30.46 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  31.79 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  33.62 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  28.99 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.8 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  38.95 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  47.83 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  37 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  40.23 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  27.84 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  47.62 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  27.84 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  27.84 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.92 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  33.07 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.84 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  24.72 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  32.58 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37.36 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  49.18 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.79 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.78 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  36.17 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  36.17 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.42 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  48.39 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  40 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.01 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.97 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.23 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  37.36 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  32.11 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.21 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.86 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.17 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  46.77 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.58 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.86 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3107  N-terminal methylation site  31.69 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.91 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  32.14 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.04 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.04 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.86 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.04 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  33.72 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.56 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  36.92 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  41.94 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  36.71 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  44 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.51 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  45 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.78 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  36.36 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  26.5 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.91 
 
 		 164 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  49.02 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  41.96 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  38.39 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  42 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  47.92 
 
 		 168 aa  51.6  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.73 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.16 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  32.95 
 
 		 163 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  21.59 
 
 		 170 aa  51.6  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  41.96 
 
 		 170 aa  51.6  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>