101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4247 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1055 aa  2119    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 
991 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
1060 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  22.49 
 
 
717 aa  86.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
1215 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.84 
 
 
1007 aa  81.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.67 
 
 
2741 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  27.24 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  30.3 
 
 
903 aa  79.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 
2741 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 
937 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.18 
 
 
919 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.67 
 
 
1328 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.62 
 
 
968 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4245  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
372 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  23.84 
 
 
725 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
916 aa  72.8  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
822 aa  71.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 
1476 aa  71.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.6 
 
 
828 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  33.33 
 
 
1142 aa  70.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  28.57 
 
 
1051 aa  69.3  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
796 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  26.07 
 
 
950 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
1025 aa  67.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
1162 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.21 
 
 
1162 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.76 
 
 
1009 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
729 aa  67.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  23.33 
 
 
698 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  25.71 
 
 
950 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
928 aa  66.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 
851 aa  65.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  25.76 
 
 
853 aa  65.1  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  24.86 
 
 
891 aa  64.7  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
883 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
868 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
905 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
905 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 
1365 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  25.45 
 
 
845 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  25.81 
 
 
840 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.85 
 
 
809 aa  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  30.63 
 
 
1025 aa  61.6  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  21.74 
 
 
944 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  27.63 
 
 
1246 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.61 
 
 
904 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 
1247 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
1192 aa  59.3  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.7 
 
 
957 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.78 
 
 
854 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  30.52 
 
 
1171 aa  57.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  33.67 
 
 
884 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  33.57 
 
 
1039 aa  56.2  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
1036 aa  56.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
923 aa  55.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
851 aa  55.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  24.09 
 
 
960 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 
852 aa  55.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  29.66 
 
 
1475 aa  54.7  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
846 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  29.27 
 
 
905 aa  54.3  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
1247 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  23.63 
 
 
893 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 
1363 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  29.6 
 
 
1104 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  29.63 
 
 
874 aa  52.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  28.75 
 
 
371 aa  51.6  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  25.31 
 
 
1831 aa  51.2  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
1276 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
854 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
1409 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
1779 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
868 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  32.97 
 
 
909 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
994 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  28.72 
 
 
1096 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  31.03 
 
 
521 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  31.19 
 
 
1051 aa  49.3  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
1054 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  24.61 
 
 
1259 aa  48.9  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  24.51 
 
 
553 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3448  hypothetical protein  22.51 
 
 
847 aa  48.9  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.498192  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  27.82 
 
 
565 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  32.76 
 
 
192 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  22.17 
 
 
2159 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  32.98 
 
 
418 aa  48.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  47.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  26.47 
 
 
827 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
1285 aa  47.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  28.33 
 
 
1104 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 
1114 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
605 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  27.95 
 
 
1024 aa  46.2  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 
747 aa  45.8  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
269 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  30.66 
 
 
1077 aa  45.8  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0451  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
251 aa  45.4  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000076324  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  23 
 
 
885 aa  45.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  24.73 
 
 
934 aa  45.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>