More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0168 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  118  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 241 aa  94.7  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1655  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.928806  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  26.88 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  27.17 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 291 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 199 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2188  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 424 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  38.18 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>