138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0130 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 462 aa  939    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  46.37 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  42.01 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  43.63 
 
 		 435 aa  306  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  38.15 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  37.03 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  35.14 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  36.73 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  38.67 
 
 		 446 aa  256  9e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  39.48 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  35.24 
 
 		 447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  36.27 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  34.88 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  36 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.92 
 
 		 450 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  33.68 
 
 		 438 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  33.09 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  33.79 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  33.76 
 
 		 450 aa  200  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  31.2 
 
 		 431 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.16 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 417 aa  130  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 442 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  30.63 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.87 
 
 		 437 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 449 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.56 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  26.87 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.39 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.37 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.44 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.09 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.14 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  32.67 
 
 		 157 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.71 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  21.91 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 457 aa  57  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.54 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 504 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 436 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.13 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.05 
 
 		 430 aa  50.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.33 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>