More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0416 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 228 aa  441  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  46.19 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  44.39 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  40.89 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 196 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  37.62 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 198 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 		 198 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 210 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  40.11 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 185 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 193 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 193 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 205 aa  98.2  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  29.57 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
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NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04117  predicted transcriptional regulator  27.98 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5772  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4834  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04081  hypothetical protein  27.98 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  39.06 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  36.67 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4730  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.88373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  36.67 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
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NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 226 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
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NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
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CP001637  EcDH1_3746  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  36.59 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4822  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3762  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676263  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
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NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  33.73 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 187 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
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