244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32940 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  363  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  54.79 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  53.72 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  52.13 
 
 		 196 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  43.39 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  50.38 
 
 		 205 aa  94.7  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  39.23 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  31.58 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  35.4 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  50.98 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  50.91 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 241 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 234 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 234 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  38.36 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  33.91 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  30.73 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  28.93 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  47.06 
 
 		 241 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 228 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 237 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  38.6 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  40.79 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  31.3 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  27.86 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 408 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  32.31 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 305 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  31.06 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>