131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7392 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 362 aa  698    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  43.67 
 
 		 407 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  40.97 
 
 		 405 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  41.88 
 
 		 434 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  42.36 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 466 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 526 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 563 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  29.58 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  29.19 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  33.09 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  29.19 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  22.07 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 405 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 553 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  28.37 
 
 		 525 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.85 
 
 		 525 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 558 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  32.95 
 
 		 425 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 493 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  24.34 
 
 		 542 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  28.83 
 
 		 460 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  36.57 
 
 		 554 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  28.5 
 
 		 741 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  31.11 
 
 		 739 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  38.1 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  35.92 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  30.25 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  29.1 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 410 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 410 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.21 
 
 		 410 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  30.81 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  19.12 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  26.09 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.21 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.21 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  35.51 
 
 		 510 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  30.3 
 
 		 478 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 312 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  39.39 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  26.09 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.36 
 
 		 509 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  30.3 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  33.83 
 
 		 665 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  35.43 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  30.08 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40.86 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.83 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  33.99 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  38.38 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  39.13 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  38.38 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  33.07 
 
 		 619 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.72 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  30.77 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  27.21 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  30.56 
 
 		 524 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  32.79 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  37 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  26.67 
 
 		 740 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  33.07 
 
 		 705 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 564 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.46 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 425 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  37.62 
 
 		 419 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  28.42 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  36.59 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  36.63 
 
 		 408 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  39.22 
 
 		 429 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  25.46 
 
 		 385 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  34.91 
 
 		 426 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.46 
 
 		 385 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  25.46 
 
 		 385 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  40.59 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  40.59 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  40.59 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  33.13 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.46 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  23.28 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  42.25 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.09 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  35.35 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  34.48 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>