More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5475 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  39.78 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  43.79 
 
 		 202 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 201 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  33.71 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  32.95 
 
 		 200 aa  92  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  31.61 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  46.59 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.7 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 188 aa  72  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.14 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.42 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  36.6 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 770 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
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NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
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NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  25.93 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
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NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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