More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1735 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  32.91 
 
 		 1344 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  36.32 
 
 		 1311 aa  713    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  100 
 
 		 1343 aa  2773    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  34.76 
 
 		 1298 aa  728    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  31.24 
 
 		 1370 aa  589  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  29.84 
 
 		 1378 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  29.88 
 
 		 1355 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.97 
 
 		 1347 aa  553  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  28.9 
 
 		 1397 aa  546  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  30.15 
 
 		 1306 aa  542  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  27.46 
 
 		 1363 aa  537  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  29.49 
 
 		 1374 aa  532  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  31.1 
 
 		 1388 aa  529  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  28.32 
 
 		 1378 aa  523  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  34.8 
 
 		 1384 aa  523  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  28.47 
 
 		 1373 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  28.01 
 
 		 1342 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  27.83 
 
 		 1404 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  29.96 
 
 		 1374 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  26.39 
 
 		 1400 aa  499  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  29.22 
 
 		 1355 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  27.35 
 
 		 1334 aa  499  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  27.15 
 
 		 1373 aa  499  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  32 
 
 		 1366 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 1349 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  34.76 
 
 		 1418 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  26.55 
 
 		 1316 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  27.76 
 
 		 1327 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  27.29 
 
 		 1340 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  28.48 
 
 		 1313 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  33.2 
 
 		 1335 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  28.13 
 
 		 1278 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  27.29 
 
 		 1344 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.46 
 
 		 1396 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  27.27 
 
 		 1347 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  27.18 
 
 		 1526 aa  425  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  25.17 
 
 		 1374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  26.53 
 
 		 1407 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  34.81 
 
 		 1366 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 677 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  32.58 
 
 		 1324 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  42.13 
 
 		 663 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  28.26 
 
 		 1105 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  29.74 
 
 		 1376 aa  364  5.0000000000000005e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  24.33 
 
 		 1414 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 668 aa  348  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 934 aa  341  5e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  26.9 
 
 		 1070 aa  335  4e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  26.18 
 
 		 1070 aa  334  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 904 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  25.29 
 
 		 1093 aa  312  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  24.46 
 
 		 1086 aa  310  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  35.27 
 
 		 940 aa  304  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  28.21 
 
 		 1296 aa  289  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  33.09 
 
 		 993 aa  283  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  25.24 
 
 		 1346 aa  280  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 1048 aa  273  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 1426 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 1341 aa  272  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  36.63 
 
 		 1427 aa  270  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  25 
 
 		 1278 aa  267  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  23.52 
 
 		 1351 aa  264  8e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1415 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  23.73 
 
 		 1118 aa  259  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  37.94 
 
 		 1299 aa  258  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1013 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  36.98 
 
 		 1202 aa  255  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 1131 aa  255  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 1645 aa  254  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 1390 aa  251  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  32.04 
 
 		 961 aa  251  7e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 1390 aa  250  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 1498 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 1390 aa  250  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  28.3 
 
 		 1024 aa  249  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 1711 aa  248  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1406 aa  248  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  23.95 
 
 		 1114 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 1383 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  34.85 
 
 		 876 aa  244  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 1431 aa  244  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 1559 aa  244  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 1002 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1010 aa  241  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 1631 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 1385 aa  241  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 1153 aa  241  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 1079 aa  239  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 1258 aa  239  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1287 aa  236  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 975 aa  236  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.69 
 
 		 1152 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 1383 aa  233  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 1118 aa  232  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.87 
 
 		 1051 aa  230  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  30.86 
 
 		 1179 aa  230  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1248 aa  230  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  30.71 
 
 		 1190 aa  231  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 1140 aa  231  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1651 aa  229  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>