More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0074 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 567 aa  1143    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 573 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  34.67 
 
 		 573 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  34.29 
 
 		 573 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.91 
 
 		 572 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.98 
 
 		 572 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.78 
 
 		 566 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.58 
 
 		 632 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 565 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 594 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 		 563 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 594 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.68 
 
 		 599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.31 
 
 		 557 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1676 aa  167  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 722 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 		 581 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 575 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.94 
 
 		 553 aa  144  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  22.94 
 
 		 603 aa  143  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 581 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.47 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  32.43 
 
 		 677 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 878 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 572 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  31.13 
 
 		 425 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  32.91 
 
 		 583 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 566 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  25.44 
 
 		 593 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  26.25 
 
 		 572 aa  136  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  30.27 
 
 		 619 aa  135  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  25.88 
 
 		 621 aa  134  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 579 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 617 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 		 574 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  25.71 
 
 		 621 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 584 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  30.9 
 
 		 593 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 621 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  27.16 
 
 		 562 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  28.05 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  26.15 
 
 		 584 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  24.47 
 
 		 573 aa  127  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 595 aa  126  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 585 aa  126  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  27.83 
 
 		 591 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  30.68 
 
 		 616 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.58 
 
 		 1979 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.29 
 
 		 810 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 		 610 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  27.19 
 
 		 575 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 556 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 		 571 aa  123  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 4079 aa  123  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 607 aa  123  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 573 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.63 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.22 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.67 
 
 		 2240 aa  122  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  29.82 
 
 		 625 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 638 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  29.69 
 
 		 584 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 616 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 		 562 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 592 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  24.3 
 
 		 592 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.41 
 
 		 725 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 		 594 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  26.25 
 
 		 586 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 729 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 599 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.2 
 
 		 1056 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  26.7 
 
 		 573 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 883 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 566 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.7 
 
 		 1737 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 642 aa  117  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.37 
 
 		 887 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 622 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 927 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20.45 
 
 		 1276 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 613 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 607 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  27.96 
 
 		 607 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 607 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 		 613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.22 
 
 		 1694 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>