More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0048 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  76.47 
 
 		 227 aa  321  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  75.86 
 
 		 214 aa  315  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  52.13 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  51.9 
 
 		 213 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  52.86 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  51.9 
 
 		 213 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  51.9 
 
 		 213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  56.99 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  51.67 
 
 		 216 aa  204  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  49.03 
 
 		 218 aa  203  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  50.73 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  51.05 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  49.28 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  51.6 
 
 		 209 aa  174  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  49.48 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  43.94 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  42.16 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  45.79 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  43.15 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  43.96 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  40.87 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  40.19 
 
 		 247 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  40.65 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  40.19 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  40.19 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  41.95 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  41.12 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  40.19 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  42.19 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  42.51 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  37.98 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  40.95 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  34.63 
 
 		 221 aa  121  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  34.24 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  34.5 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.65 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  28.72 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  30.26 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.76 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  27.64 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  29.87 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  28.12 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  29.87 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  28.12 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  28.12 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  28.12 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  29.87 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  28.12 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  28.34 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  25.64 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  25.36 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  32.05 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29.65 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>