More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3565 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  100 
 
 		 402 aa  834    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  37.69 
 
 		 482 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  37.44 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  32.43 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  34.62 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  31.64 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  33.33 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  33.92 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  33.42 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  32.52 
 
 		 393 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  30.93 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  32.74 
 
 		 388 aa  166  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  33.88 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  29.01 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  31.66 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  35.94 
 
 		 359 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  33.33 
 
 		 354 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  33.33 
 
 		 354 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  35 
 
 		 367 aa  136  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  39.34 
 
 		 251 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  46.5 
 
 		 159 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  27.75 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  27.5 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  27.5 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.37 
 
 		 421 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  44.65 
 
 		 172 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  33.59 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  29.85 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  27.57 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  30.61 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  26.75 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 420 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  32.06 
 
 		 407 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  27.48 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  27.07 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  28.19 
 
 		 452 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  29.35 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  30.43 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  30.77 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  26.14 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  29.2 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.27 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  26.37 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  27.03 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  27.03 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.82 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  27.25 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  27.86 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 432 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  29.6 
 
 		 412 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  27.43 
 
 		 399 aa  112  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.87 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  28.13 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  25.19 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  27.82 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  27.75 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.82 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.86 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  26.51 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  24.49 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.22 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.08 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  32.48 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30.71 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.85 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  30.68 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.46 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  32.63 
 
 		 398 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  27.49 
 
 		 500 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.43 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  34.21 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  31.89 
 
 		 392 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  34.2 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  34.2 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  27.58 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  26.7 
 
 		 452 aa  106  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  27.69 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  24.43 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  28.06 
 
 		 451 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  28.45 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  25.83 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  27.25 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.95 
 
 		 404 aa  103  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  33.61 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.61 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  26.42 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  31.95 
 
 		 339 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  28.89 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  26.78 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  30.65 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>