More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0641 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1085 aa  655    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  43.96 
 
 		 761 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1094 aa  2270    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  59.78 
 
 		 3035 aa  946    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  64.02 
 
 		 4489 aa  1036    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  47.97 
 
 		 732 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  56.14 
 
 		 3560 aa  881    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 909 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  46.22 
 
 		 654 aa  544  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  46.46 
 
 		 618 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  43.12 
 
 		 740 aa  532  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.31 
 
 		 816 aa  509  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 739 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 		 750 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 647 aa  449  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 700 aa  430  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 		 660 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 		 667 aa  426  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 808 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  40.56 
 
 		 616 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  44.8 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  39.09 
 
 		 611 aa  379  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  43.39 
 
 		 492 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  44.32 
 
 		 459 aa  361  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  41.85 
 
 		 452 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 750 aa  344  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 706 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  55.05 
 
 		 295 aa  337  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  36.64 
 
 		 560 aa  337  5.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  49.72 
 
 		 395 aa  327  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 789 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  47.61 
 
 		 632 aa  317  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 833 aa  317  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 833 aa  313  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  40.36 
 
 		 657 aa  311  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 828 aa  310  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  42.16 
 
 		 657 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  34.06 
 
 		 672 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 824 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 828 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  36.52 
 
 		 568 aa  304  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  39.42 
 
 		 566 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 828 aa  294  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 713 aa  291  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  32.02 
 
 		 680 aa  290  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 632 aa  290  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  41.87 
 
 		 633 aa  288  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  40.64 
 
 		 637 aa  285  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  37.12 
 
 		 590 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 754 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  43.94 
 
 		 1694 aa  283  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 		 590 aa  281  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  40.85 
 
 		 630 aa  278  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1276 aa  277  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 718 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 732 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.79 
 
 		 570 aa  275  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.74 
 
 		 1106 aa  274  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 754 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1106 aa  270  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.11 
 
 		 739 aa  266  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  37.47 
 
 		 588 aa  263  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  33.27 
 
 		 582 aa  263  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 708 aa  259  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  28.49 
 
 		 715 aa  254  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  36.44 
 
 		 624 aa  253  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 968 aa  251  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.51 
 
 		 742 aa  247  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.86 
 
 		 585 aa  241  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 		 667 aa  240  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.51 
 
 		 739 aa  231  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.76 
 
 		 589 aa  228  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 627 aa  227  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 598 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  28.34 
 
 		 937 aa  226  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 685 aa  224  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 734 aa  224  9e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 595 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 619 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 1714 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 626 aa  221  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  41.57 
 
 		 740 aa  221  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  26.75 
 
 		 699 aa  220  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 681 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 543 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.94 
 
 		 810 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  35.65 
 
 		 764 aa  217  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 717 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 878 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  40.44 
 
 		 865 aa  215  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  26.21 
 
 		 821 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 647 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  25.75 
 
 		 708 aa  214  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 		 776 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 		 776 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 		 776 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 711 aa  211  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  25.9 
 
 		 821 aa  211  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 789 aa  210  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>