119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1685 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  40.78 
 
 
905 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  41.21 
 
 
905 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
891 aa  1788    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  40.99 
 
 
868 aa  596  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.96 
 
 
854 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  40.09 
 
 
950 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  39.65 
 
 
950 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 
885 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 
851 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  37.51 
 
 
960 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  37.75 
 
 
944 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  36.45 
 
 
853 aa  517  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.06 
 
 
904 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  35.81 
 
 
845 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  35.51 
 
 
840 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 
822 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 
883 aa  357  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 
796 aa  284  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  31.29 
 
 
698 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  30.87 
 
 
553 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 
725 aa  180  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.57 
 
 
3299 aa  180  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.42 
 
 
3298 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  33.62 
 
 
1009 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.35 
 
 
957 aa  175  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.33 
 
 
1772 aa  174  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  33.79 
 
 
447 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  38.39 
 
 
1650 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.37 
 
 
3537 aa  167  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.42 
 
 
3535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.42 
 
 
3419 aa  167  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.75 
 
 
2637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  32.08 
 
 
809 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  29.27 
 
 
418 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
949 aa  143  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 
828 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 
1060 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 
991 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.68 
 
 
2741 aa  108  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.86 
 
 
1328 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  27.99 
 
 
919 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  24.43 
 
 
717 aa  104  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.06 
 
 
2741 aa  99.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
1215 aa  95.1  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  33.74 
 
 
192 aa  91.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 
729 aa  91.7  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
846 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.45 
 
 
1162 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
1162 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
916 aa  81.6  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.86 
 
 
532 aa  81.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  28.62 
 
 
884 aa  81.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.27 
 
 
968 aa  80.9  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
937 aa  75.1  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  27.9 
 
 
903 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.82 
 
 
893 aa  72.8  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
851 aa  72  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
854 aa  70.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
1054 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.63 
 
 
1238 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  27.44 
 
 
827 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
1036 aa  64.7  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 
1365 aa  64.7  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
1409 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  25.26 
 
 
1051 aa  62.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  24.48 
 
 
909 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  28.99 
 
 
1024 aa  61.6  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  62  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  26.39 
 
 
1039 aa  61.2  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
1025 aa  61.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  23.21 
 
 
1025 aa  60.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 
994 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 
1055 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  25.54 
 
 
874 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.31 
 
 
1475 aa  58.9  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 
1186 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  26.23 
 
 
565 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  32 
 
 
1246 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  28.98 
 
 
811 aa  54.3  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.27 
 
 
782 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  33.1 
 
 
1142 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
923 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  34.38 
 
 
937 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  22.52 
 
 
1180 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
868 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.26 
 
 
1135 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  26.04 
 
 
1171 aa  52.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  28.93 
 
 
989 aa  52.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  28.29 
 
 
897 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  28.24 
 
 
890 aa  52  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  25.55 
 
 
1051 aa  52  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
880 aa  51.2  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.82 
 
 
1044 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
368 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  26.44 
 
 
918 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
928 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.9 
 
 
1507 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  26.18 
 
 
873 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  31.85 
 
 
909 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.76 
 
 
810 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>