More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  58.52 
 
 		 1572 aa  1618    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  51.51 
 
 		 1586 aa  1416    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  52.63 
 
 		 1595 aa  1516    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  57.09 
 
 		 1576 aa  1692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  100 
 
 		 1614 aa  3318    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  42.13 
 
 		 1611 aa  1134    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  39.1 
 
 		 1565 aa  897    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  39.1 
 
 		 1565 aa  897    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  31.13 
 
 		 1586 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  31.29 
 
 		 1362 aa  436  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  30.87 
 
 		 1554 aa  432  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  31.91 
 
 		 1520 aa  427  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1411 aa  423  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  30.59 
 
 		 1547 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1550 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  32.16 
 
 		 1527 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  31.87 
 
 		 1348 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  29.55 
 
 		 1560 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  30.46 
 
 		 1446 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  30.57 
 
 		 1551 aa  413  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  32.01 
 
 		 1385 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  31.38 
 
 		 1421 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  31.62 
 
 		 1400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  30.24 
 
 		 1609 aa  399  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  29.5 
 
 		 1386 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  30.86 
 
 		 1409 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  30.69 
 
 		 1509 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  29.38 
 
 		 1384 aa  382  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  29.83 
 
 		 1485 aa  382  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  29.6 
 
 		 1508 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  29.94 
 
 		 1259 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.99 
 
 		 1626 aa  370  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  29.97 
 
 		 1419 aa  365  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  28.86 
 
 		 1528 aa  365  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  30.45 
 
 		 1531 aa  363  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1197 aa  363  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  28.76 
 
 		 1573 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  28.79 
 
 		 1434 aa  358  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  29.14 
 
 		 1518 aa  358  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  30.07 
 
 		 1429 aa  357  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.38 
 
 		 1981 aa  355  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  30.06 
 
 		 1488 aa  354  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  34.38 
 
 		 867 aa  353  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  34.2 
 
 		 866 aa  353  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  28.68 
 
 		 1489 aa  347  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  28.38 
 
 		 1495 aa  338  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1602 aa  334  8e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  28.99 
 
 		 1528 aa  328  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  29.25 
 
 		 1568 aa  328  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  30.14 
 
 		 1517 aa  327  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1410 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  31.06 
 
 		 924 aa  322  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  27.76 
 
 		 1530 aa  320  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  29.17 
 
 		 1359 aa  316  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1699 aa  314  7.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  29.35 
 
 		 1379 aa  313  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  29.91 
 
 		 1494 aa  313  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1494 aa  313  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1552 aa  310  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  28.02 
 
 		 1543 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1495 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1229 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.58 
 
 		 1527 aa  305  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1189 aa  305  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  27.32 
 
 		 1423 aa  301  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  29.03 
 
 		 1418 aa  300  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1390 aa  298  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  28.71 
 
 		 1673 aa  298  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  28.57 
 
 		 1679 aa  298  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  27.61 
 
 		 1457 aa  292  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1402 aa  290  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  27.97 
 
 		 1475 aa  288  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  30.49 
 
 		 1487 aa  287  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  27.38 
 
 		 1639 aa  283  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1492 aa  281  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  27.9 
 
 		 1437 aa  280  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1466 aa  276  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1541 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1541 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1541 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  27.27 
 
 		 1422 aa  274  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1541 aa  274  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1381 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  27.71 
 
 		 1541 aa  273  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  27.56 
 
 		 1541 aa  272  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  27.94 
 
 		 1401 aa  272  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1620 aa  271  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  26.16 
 
 		 1593 aa  271  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  26.67 
 
 		 1447 aa  267  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  26.4 
 
 		 1539 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  26.65 
 
 		 1428 aa  264  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  26.02 
 
 		 1539 aa  262  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.9 
 
 		 1579 aa  261  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1600 aa  261  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.74 
 
 		 1428 aa  260  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1553 aa  260  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1840 aa  259  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1352 aa  259  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1368 aa  258  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1604 aa  258  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>