More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2343 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  100 
 
 		 464 aa  928    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  42.61 
 
 		 475 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  34.69 
 
 		 475 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 445 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  30.43 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 486 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  30 
 
 		 438 aa  192  8e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  30.17 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 469 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30 
 
 		 500 aa  186  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 499 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 498 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.92 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 462 aa  177  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 475 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 490 aa  176  9e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  30.41 
 
 		 525 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 464 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 464 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 452 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.98 
 
 		 463 aa  166  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 464 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.3 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 554 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  26.53 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  26.53 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 464 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 456 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 447 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 447 aa  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 468 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  28.66 
 
 		 502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  29.29 
 
 		 547 aa  146  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 495 aa  146  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  29.29 
 
 		 547 aa  146  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  29.29 
 
 		 546 aa  146  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  28.96 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  29.29 
 
 		 546 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  29.03 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  28.79 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  29.06 
 
 		 495 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 505 aa  144  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 445 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 458 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  28.48 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 448 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 498 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  28.48 
 
 		 476 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  28.29 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  28.29 
 
 		 474 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 453 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>