158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1935 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  363  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  43.39 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  43.79 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 205 aa  84.7  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  44.92 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  34.34 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  42.24 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  38.83 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  32.57 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  31.76 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  33.71 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  35.2 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  32.8 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  28.65 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  43.14 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 241 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 237 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  35.2 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  52.08 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 429 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  39.22 
 
 		 241 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 414 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  31.19 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 198 aa  44.7  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  29.32 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>